Ну хорошо.. предположим, что все так. Но возникает куча вопросов по поводу феномена сознания.
откуда в человеке, да и не только, появляется способность мыслить?
с чем это может быть связано?

ИМХО, "способность мыслить" - это что-то вроде усложнённых рефлексов. Приведу пример; на этот раз организм посложнее: я подношу к кошке руку, якобы собираясь её погладить, а вместо этого ударяю по голове. Повторяю несколько раз. Естественно, в её нейросетке (чистая физика/химия) происходят какие-то взаимодействия, и со временем кошка уже готовится к удару. Получается, она может типа мыслить. Но только о том, что непосредственно видит (хотя в течении ещё нескольких минут она будет с подозрением относиться ко мне - а это уже почти абстрактное мышление). А у человека ИМХО всё то же самое, но опять же сложнее... Человеческое существо содержит довольно большую нейросеть, на её базе и построены эти усложнённые рефлексы, читай "сознание". Всё ИМХО ;)