Психотерапия - это одно из практических применений психологии, ведь так?

Примерно так же, как фармацептическая медицина одно из практических применений химии. Если, например, некий робот совершенно не воспринимает воздействие лечебных таблеток - это не значит, что он неподвластен химическим реакциям как таковым :).

Но разум в данном случае работает как вахтёр, который проверяет у прилезшего из подсознания документы и решает - пускать или нет.

Если, допустим, кого-то "уронили" в детстве так, что у него не генерируются какие-то определенные мысли, то он, следовательно, не будет проводить их логический анализ, не будет делать соотв. выводы, принимать соотв. решения и т.д. Он будет другим челоеком, с другим мировоззрением и жизнью (насколько другими - вопрос конкретного случая), чем был бы, если бы его не "уронили" в детстве. При этом мы подразумеваем, что его сознательное мышление на 100% логичное и незамороченное. Даже если "обработчик" работает идеально, определяющую роль играют данные, которые в него забрасываются...

У кого-то, наоборот, из-за "уроненности" может возникать повышенное кол-во мыслей на какие-то темы. Как следствие, такой индивид больше обдумывает эти темы, больше углубляется в них и т.д. Возможно, он станет в этой сфере хорошим экспертом. Но не станет в других сферах, в которых стал бы, если бы не произошедший "урон". Поэтому, имхо, нет пока того "разума, к которому неприменима психология". Да и вообще, это по определению невозможно. Психология изучает структуру и механизмы того, что у нас в голове. Что бы там ни было, она остается применимой.